雙序列密碼子比對工具能夠用最優化的方式比對兩個序列。比對所用的打分矩陣來自于Schneider et al. (2005)。此雙序列密碼子比對工具用于查找保守編碼區。只允許ACGTU作為合法堿基字符。
輸入第一序列或者FASTA格式序列，長度限定在6000以內。
輸入第二序列或者FASTA格式序列，長度限定在6000以內。
使用以下參數來指定如何得分排列。
* 序列前有跳配（Gap）得 6 5 4 3 2 1 0 -1 -2 -3 -4 -5 -6
* 序列中間有跳配（Gap）得 6 5 4 3 2 1 0 -1 -2 -3 -4 -5 -6
* 序列后有跳配（Gap）得 6 5 4 3 2 1 0 -1 -2 -3 -4 -5 -6 分
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